MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017424	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017424	GAA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017424	A	8	8	1325	1332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017424	AT	3	6	1412	1417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017424	TGA	2	6	1466	1471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017424	AGG	2	6	1610	1615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017424	TTGC	2	8	1618	1625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017424	GTTC	2	8	1683	1690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017424	GA	3	6	1745	1750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017424	ATTAA	2	10	1786	1795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017424	A	6	6	1797	1802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017424	TTC	3	9	1815	1823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017424	AGA	2	6	1860	1865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017424	AGG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017424	AGG	2	6	7823	7828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017424	TAAAG	2	10	11918	11927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017424	TA	3	6	15181	15186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017424	TAAAAA	2	12	15196	15207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017424	CAA	2	6	16512	16517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017424	AAT	3	9	17093	17101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017424	TC	3	6	17138	17143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017424	ATTTT	2	10	17196	17205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017424	AAGGA	2	10	17230	17239	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017424	ATAAAA	2	12	17894	17905	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017424	ATT	2	6	17912	17917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017424	AGC	2	6	17926	17931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017424	TCC	2	6	18907	18912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017424	T	6	6	18915	18920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017424	AATA	2	8	18922	18929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017424	TA	3	6	18934	18939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017424	T	6	6	18961	18966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017424	A	6	6	18969	18974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017424	A	7	7	18981	18987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017424	TAT	2	6	19008	19013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017424	CTA	2	6	19014	19019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017424	T	7	7	19048	19054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017424	A	6	6	19063	19068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017424	TTGTA	2	10	19110	19119	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017424	TAA	2	6	19190	19195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017424	T	7	7	19209	19215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017424	CAT	2	6	19248	19253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017424	ATT	2	6	19254	19259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017424	ATT	2	6	19261	19266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017424	A	6	6	19272	19277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017424	GA	3	6	19281	19286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017424	T	6	6	22836	22841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017424	TGA	2	6	22862	22867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017424	TAT	2	6	22872	22877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017424	T	6	6	22926	22931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017424	TTTTA	2	10	22955	22964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017424	ACAAAT	2	12	22965	22976	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017424	AT	3	6	22998	23003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017424	ATT	2	6	23007	23012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017424	ATT	2	6	23028	23033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017424	TAA	2	6	23035	23040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017424	TTA	2	6	23064	23069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017424	AAT	2	6	23071	23076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017424	AT	5	10	23114	23123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017424	A	6	6	23138	23143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017424	CAATC	2	10	23161	23170	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017424	TAAA	2	8	23207	23214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017424	T	7	7	23223	23229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017424	T	6	6	23236	23241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017424	A	6	6	23244	23249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017424	TA	3	6	23272	23277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017424	TATT	2	8	23282	23289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017424	A	6	6	23291	23296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017424	AGG	2	6	23298	23303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017424	A	6	6	24647	24652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017424	A	7	7	24655	24661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017424	AGG	2	6	24674	24679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017424	ATTA	2	8	24680	24687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017424	GTT	2	6	25913	25918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017424	AAGTAA	2	12	25930	25941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017424	A	6	6	25953	25958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017424	TGCA	2	8	26016	26023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017424	TAA	2	6	26047	26052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017424	AGT	2	6	26058	26063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017424	GGT	2	6	26074	26079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017424	AAGA	2	8	26084	26091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017424	AT	3	6	26108	26113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017424	AATTT	2	10	26128	26137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017424	GA	3	6	26183	26188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017424	TA	3	6	26255	26260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017424	ATT	2	6	26283	26288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017424	TA	3	6	27368	27373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017424	A	6	6	27392	27397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017424	GTT	2	6	27404	27409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017424	T	7	7	27411	27417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017424	TTTA	2	8	27503	27510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017424	TA	3	6	27509	27514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017424	CT	3	6	27515	27520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017424	TAA	2	6	28106	28111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017424	ATA	2	6	28115	28120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017424	ATA	2	6	28154	28159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017424	AGTT	2	8	28213	28220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.